МОДЕЛИРОВАНИЕ КЛЕТОЧНЫХ МЕМБРАН
Ученые из МФТИ создали метод моделирования, способный с высокой точностью и относительно быстро описывать «ответные реакции» клеточных мембран на молекулы лекарств и токсинов. Это позволит заранее, без всяких экспериментов просчитывать влияние препаратов на клетки. Исследование опубликовано в Journal of Chemical Theory and Information.
Моделировать поведение биологических молекул крайне трудно, поскольку нужно описывать движение каждого ее атома – даже для небольшой молекулы из 54 атомов получится 156 наборов чисел. Авторы исследования использовали для обработки исходящих данных метод главных компонент – способ обработки, который выделяет из данных наиболее существенные. Это в 10 раз сократило объем данных, а точность снизилась лишь на 10%.
Метод был проверен на липидной молекуле DOPC (диолеоилфосфатидилхолин), хорошо изученной экспериментально. Оказалось, что для описания движения молекулы из 54 атомов достаточно всего 14 «компонент», то есть совместных движений какой-то группы атомов в молекуле.
Из молекул липидов строится клеточная мембрана. Любые молекулы, чтобы подействовать на клетку, должны преодолеть ее. Поэтому изучение поведения липидов с точностью до отдельных атомов поможет предсказывать влияние лекарств, токсинов на клетки и организм в целом, а следовательно, значительно ускорить поиск новых лекарственных веществ и испытания препаратов. Помимо этого моделирование может помочь в исследовании механизмов старения. По некоторым предположениям, механизмы эти связаны с изменением структуры мембран клеток.
Ксения Цветкова
СВОБОДУ НАУЧНЫМ ПУБЛИКАЦИЯМ!
Совет по конкурентоспособности (Competitiveness Council) Европейского союза на своем заседании в Брюсселе выступил с инициативой к 2020 году обеспечить свободный доступ ко всем научным публикациям. Об этом сообщает журнал Science. Некоторые эксперты уже назвали решение совета добиваться скорейшего обеспечения свободного доступа ко всем научным публикациям «изменяющим жизнь» («live-changing») предложением. Хотя многие обозреватели сомневаются, что удастся за 3–4 года, достигнуть этой цели, в то же время они считают саму постановку такой цели весьма важным шагом. Один из самых активных борцов за обеспечение открытого доступа к научным публикациям Стеван Харнад из университета Квебека считает, что эта цель вполне достижима и само по себе движение к ней станет важным вкладом в развитие науки. С одобрением решения европейских научных лидеров выступило также руководство Лиги научных университетов (LERU) Европы. В их заявлении подчеркивается, что упомянутое решение – важнейший шаг к созданию открытой системы научных исследований.
Юлдуз Халиуллин
Екатерина Трифонова 
